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1、真菌鏡檢
是最簡(jiǎn)單也是很有價(jià)值的實(shí)驗室診斷方法。其優(yōu)點(diǎn)在于簡(jiǎn)便、快速,無(wú)菌部位的陽(yáng)性結果可直接確定真菌感染。但是由于陽(yáng)性率較低,陰性結果亦不能排除診斷。直 接鏡檢對于淺表和皮下真菌感染最有幫助。在皮膚刮屑、毛發(fā)或甲標本中發(fā)現皮膚癬菌、念珠菌和馬拉色菌的成分可提供對相應真菌病的可靠診斷。如在無(wú)菌體液的 直接鏡檢中發(fā)現真菌成分常可確立深部真菌病的診斷,例如在腦脊液中檢測到帶莢膜的新生隱球菌酵母細胞,或外周血涂片中檢測到莢膜組織胞漿菌細胞。但一般在 有菌部位則只有發(fā)現大量真菌菌絲方才有意義,通過(guò)直接鏡檢一般可以區分念珠菌、隱球菌、暗色真菌、毛霉(接合菌)等菌的感染,進(jìn)一步明確鑒定菌種需要通過(guò) 培養鑒定來(lái)完成。
2、真菌培養
真菌培養是實(shí)驗室檢查中的重要環(huán)節,培養出致病真菌是進(jìn)一步鑒定菌種的前提條件。真菌培養第一步是從臨床標本中培養真菌的初代培養,初代培養后進(jìn)一步進(jìn)行 分離純化培養和鑒定培養。不同致病真菌每一步所采用的培養基,培養時(shí)間和培養溫度存在一定的差異。常規的真菌培養需要在28-30°C溫度下培養3-4 周,一般初代培養選用沙氏培養基(SDA)或者馬鈴薯瓊脂培養基(PDA),采用試管培養,一般同時(shí)培養兩管,其中一管可添加抗生素(氯霉素或慶大霉素均 可)。在培養1周內,應該每天觀(guān)察有無(wú)真菌生長(cháng)。一般培養4周后,如果無(wú)真菌生長(cháng)可報陰性。發(fā)現培養出真菌,直接挑取少量菌體或者小培養后,用乳酸酚棉蘭 制成涂片顯微鏡下觀(guān)察,結合菌落大體形態(tài),典型菌種可直接報告種屬。不典型菌種根據基本表現,采用適當的標準鑒定培養基,標準培養條件培養,必要時(shí)要結合 生理學(xué)和分子生物學(xué)方法進(jìn)行鑒定。
3、真菌鑒定
對常見(jiàn)致病真菌要掌握的鑒定原則是首先區分酵母菌和霉菌。
如果初代培養基上培養出酵母樣菌落,在鑒定前應進(jìn)行分離純化。在去除細菌和其他真菌污染,區分混合感染后,對純菌落進(jìn)行鑒定。酵母菌鑒定主要根據形態(tài)學(xué)特 征和生理生化特點(diǎn),按照一定的流程進(jìn)行。首先根據菌落顏色進(jìn)行分類(lèi)。臨床最為常見(jiàn)的是白色或奶白色菌落,這類(lèi)菌進(jìn)一步做芽管試驗,若芽管試驗是陽(yáng)性則為白 念珠菌,若陰性則通過(guò)Vitek YBC或API20C及玉米吐溫瓊脂上培養的形態(tài)特征來(lái)鑒定。另外,還可以應用念珠菌顯色瓊脂、尿素酶試驗等試驗來(lái)輔助鑒定。
檢驗地帶網(wǎng)
霉菌的鑒定非常復雜,有許多標準包括形態(tài)學(xué)特征、溫度耐受性,放線(xiàn)菌酮抗性、雙相性、營(yíng)養需求、蛋白分解活動(dòng)以及水解尿素能力等。現代分類(lèi)學(xué)鑒定方法主要 依據分生孢子的個(gè)體發(fā)生過(guò)程結合其他特征來(lái)進(jìn)行鑒定。初代培養后根據形態(tài)學(xué)特征一般可鑒定到屬的水平,再依據不同真菌的鑒定要求,采用標準培養基和培養條 件進(jìn)一步完成菌種鑒定。例如:曲霉屬鑒定時(shí)需要采用標準培養基,即察氏培養基和麥芽瓊脂,25℃培養7天后與曲霉形態(tài)鑒定檢索表對應得到正確的結果。
1、選取五套培養皿進(jìn)行實(shí)驗,一個(gè)做為對比,另外四個(gè)用來(lái)培養不同環(huán)境中的細菌,并且是在不同的環(huán)境中培養,以便得出細菌和真菌的生存條件。
2、培養皿經(jīng)過(guò)高溫滅菌,準備至少5套培養皿。因為對比不同環(huán)境中的細菌與真菌的存在情況,是屬于單因素比較,所以除了采樣地點(diǎn)是變量外,進(jìn)行微生物培養的條件等也要保持一致
3、經(jīng)過(guò)高溫處理后可以將培養皿上、培養基內混有的細菌或真菌的孢子等殺死(經(jīng)過(guò)嚴格的高溫滅菌的環(huán)境中是不可能有細菌和真菌存在的),這樣就排除了實(shí)驗外其他環(huán)境的污染。因此,在實(shí)驗前不要盲目的打開(kāi)培養皿,以防止細菌或真菌的孢子等落在培養基上,實(shí)驗中用無(wú)菌棉棒的目的同樣是為了防止棉棒上的微生物污染培養基。
4、在不同的環(huán)境中細菌的分布是不相同的,因此在采集菌種的時(shí)候要注意選擇環(huán)境,做到要有一定的代表性。
5、接種好的培養基要放在特定的環(huán)境條件下進(jìn)行培養。
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GM抗原的檢測目前最主流的方法是經(jīng)典的一步法酶聯(lián)免疫試驗,目前國內外廣泛認可的檢測產(chǎn)品是由美國B(niǎo)io-Rad公司提供的曲霉菌抗原檢測試劑盒(),可快速、靈敏的發(fā)現血液循環(huán)中的GM抗原,幫助臨床實(shí)現早期發(fā)現曲霉菌感染。
GM抗原是曲霉菌半乳甘露聚糖(galactomannan,GM)抗原的簡(jiǎn)稱(chēng),是曲霉菌胞壁的組成成分,在菌絲生長(cháng)過(guò)程中可釋放人血液,檢測患者血清中GM抗原水平有助于侵襲性曲霉菌病(Invasive Aspergillosis, IA)的早期診斷。推薦首次檢測時(shí)間點(diǎn)一般為當臨床懷疑患者發(fā)生IA時(shí),或者需要對免疫妥協(xié)患者進(jìn)行常規篩查時(shí)。1另外,對于開(kāi)始進(jìn)行抗真菌治療的患者,推薦進(jìn)行每周兩次的GM水平監測,以幫助判斷臨床療效及患者預后。2
由于血清學(xué)試驗為間接檢測手段,除外檢測試劑盒的選擇,感染曲霉菌類(lèi)型、宿主本身、以及使用的診斷標準和方法等,都可能影響檢測結果。所以在檢測過(guò)程中,需要注意各種影響的因素,以盡可能獲得準確的結果,避免出現假陽(yáng)性或假陰性而干擾了最終的臨床診斷,延誤患者診治。在不考慮檢測者本身操作原因及試驗環(huán)境污染等因素的前提下,我們來(lái)了解下哪些因素可能會(huì )影響試驗結果:3
生物學(xué)因素:
· 感染部位(比如鼻竇,肺部,還是播散性)
· 感染部位的微環(huán)境(比如營(yíng)養,氧含量,PH值)
· 曲霉菌種類(lèi)
· 是否使用抗真菌藥物
· 釋放的GM抗原分子結構
· 患者免疫抑制的程度
· 腎臟清除率,肝代謝情況
· 患者體內是否存在GM抗體
· 樣本的保存條件及時(shí)間
· 患者檢測前的治療情況
流行病學(xué)因素:
· 患者所屬人群
· 當地感染流行率
· 樣本采集手段
· Cut-off值的設定
· 感染患者的界定標準
· 實(shí)驗室檢測經(jīng)驗
由于對結果的影響因素眾多,為了確保最終結果的準確性,選擇高質(zhì)量的檢測試劑盒就顯得至關(guān)重要,即便選擇了值得信賴(lài)的檢測產(chǎn)品,操作者在分析GM抗原檢測結果時(shí),還是需要結合各種客觀(guān)的影響因素,為臨床提供最為準確可性的報告。
細菌 [what]什么是細菌?細菌(英文:germs;bacteria)隸屬生物學(xué)一類(lèi),是在自然界分布最廣、個(gè)體數量最多的有機體,是大自然物質(zhì)循環(huán)的主要參與者。
細菌主要由細胞壁、細胞膜、細胞質(zhì)、核質(zhì)體等部分構成,有的細菌還有夾膜、鞭毛、菌毛等特殊結構。絕大多數細菌的直徑大小在0.5~5μm之間。
可根據形狀分為三類(lèi),即:球菌、桿菌和螺旋菌(包括弧形菌)。 還有一種利用細菌的生活方式來(lái)分類(lèi),即可分為兩大類(lèi):腐生生活與寄生生活。
(一)細胞壁 細胞壁厚度因細菌不同而異,一般為15-30nm。主要成分是肽聚糖,由n-乙酰葡糖胺和n-乙酰胞壁酸構成雙糖單元,以β(1-4)糖苷鍵連接成大分子。
n-乙酰胞壁酸分子上有四肽側鏈,相鄰聚糖纖維之間的短肽通過(guò)肽橋(革蘭氏陽(yáng)性菌)或肽鍵(革蘭氏陰性菌)橋接起來(lái),形成了肽聚糖片層,像膠合板一樣,粘合成多層。 肽聚糖中的多糖鏈在各物種中都一樣,而橫向短肽鏈卻有種間差異。
革蘭氏陽(yáng)性菌細胞壁厚約20~80nm,有15-50層肽聚糖片層,每層厚1nm,含20-40%的磷壁酸(teichoic acid),有的還具有少量蛋白質(zhì)。革蘭氏陰性菌細胞壁厚約10nm,僅2-3層肽聚糖,其他成分較為復雜,由外向內依次為脂多糖、細菌外膜和脂蛋白。
此外,外膜與細胞之間還有間隙。 肽聚糖是革蘭陽(yáng)性菌細胞壁的主要成分,凡能破壞肽聚糖結構或抑制其合成的物質(zhì),都有抑菌或殺菌作用。
如溶菌酶是n-乙酰胞壁酸酶,青霉素抑制轉肽酶的活性,抑制肽橋形成。 細菌細胞壁的功能包括:保持細胞外形;抑制機械和滲透損傷(革蘭氏陽(yáng)性菌的細胞壁能耐受20kg/cm2的壓力);介導細胞間相互作用(侵入宿主);防止大分子入侵;協(xié)助細胞運動(dòng)和分裂。
脫壁的細胞稱(chēng)為細菌原生質(zhì)體(bacterial protoplast)或球狀體(spheroplast,因脫壁不完全),脫壁后的細菌原生質(zhì)體,生存和活動(dòng)能力大大降低。 (二)細胞膜 是典型的單位膜結構,厚約8~10nm,外側緊貼細胞壁,某些革蘭氏陰性菌還具有細胞外膜。
通常不形成內膜系統,除核糖體外,沒(méi)有其它類(lèi)似真核細胞的細胞器,呼吸和光合作用的電子傳遞鏈位于細胞膜上。某些行光合作用的原核生物(藍細菌和紫細菌),質(zhì)膜內褶形成結合有色素的內膜,與捕光反應有關(guān)。
某些革蘭氏陽(yáng)性細菌質(zhì)膜內褶形成小管狀結構,稱(chēng)為中膜體(mesosome)或間體(圖3-11),中膜體擴大了細胞膜的表面積,提高了代謝效率,有擬線(xiàn)粒體(chondroid)之稱(chēng),此外還可能與dna的復制有關(guān)。 (三)細胞質(zhì)與核質(zhì)體 細菌和其它原核生物一樣,沒(méi)有核膜,dna集中在細胞質(zhì)中的低電子密度區,稱(chēng)核區或核質(zhì)體(nuclear body)。
細菌一般具有1-4個(gè)核質(zhì)體,多的可達20余個(gè)。核質(zhì)體是環(huán)狀的雙鏈dna分子,所含的遺傳信息量可編碼2000~3000種蛋白質(zhì),空間構建十分精簡(jiǎn),沒(méi)有內含子。
由于沒(méi)有核膜,因此dna的復制、rna的轉錄與蛋白的質(zhì)合成可同時(shí)進(jìn)行,而不像真核細胞那樣這些生化反應在時(shí)間和空間上是嚴格分隔開(kāi)來(lái)的。 每個(gè)細菌細胞約含5000~50000個(gè)核糖體,部分附著(zhù)在細胞膜內側,大部分游離于細胞質(zhì)中。
細菌核糖體的沉降系數為70s,由大亞單位(50s)與小亞單位(30s)組成,大亞單位含有23srrna,5srrna與30多種蛋白質(zhì),小亞單位含有16srrna與20多種蛋白質(zhì)。30s的小亞單位對四環(huán)素與鏈霉素很敏感,50s的大亞單位對紅霉素與氯霉素很敏感。
細菌核區dna以外的,可進(jìn)行自主復制的遺傳因子,稱(chēng)為質(zhì)粒(plasmid)。質(zhì)粒是裸露的環(huán)狀雙鏈dna分子,所含遺傳信息量為2~200個(gè)基因,能進(jìn)行自我復制,有時(shí)能整合到核dna中去。
質(zhì)粒dna在遺傳工程研究中很重要,常用作基因重組與基因轉移的載體。 胞質(zhì)顆粒是細胞質(zhì)中的顆粒,起暫時(shí)貯存營(yíng)養物質(zhì)的作用,包括多糖、脂類(lèi)、多磷酸鹽等。
(四)其他結構 許多細菌的最外表還覆蓋著(zhù)一層多糖類(lèi)物質(zhì),邊界明顯的稱(chēng)為莢膜(capsule),如肺炎球菌,邊界不明顯的稱(chēng)為粘液層(slime layer),如葡萄球菌。莢膜對細菌的生存具有重要意義,細菌不僅可利用莢膜抵御不良環(huán)境;保護自身不受白細胞吞噬;而且能有選擇地粘附到特定細胞的表面上,表現出對靶細胞的專(zhuān)一攻擊能力。
例如,傷寒沙門(mén)桿菌能專(zhuān)一性地侵犯腸道淋巴組織。細菌莢膜的纖絲還能把細菌分泌的消化酶貯存起來(lái),以備攻擊靶細胞之用。
鞭毛是某些細菌的運動(dòng)器官,由一種稱(chēng)為鞭毛蛋白(flagellin)的彈性蛋白構成,結構上不同于真核生物的鞭毛。細菌可以通過(guò)調整鞭毛旋轉的方向(順和逆時(shí)針)來(lái)改變運動(dòng)狀態(tài)。
菌毛是菌體表面極其的蛋白纖細,須用電鏡觀(guān)察。特點(diǎn)是:細、短、直、硬、多,菌毛與細菌運動(dòng)無(wú)關(guān),根據形態(tài)、結構和功能,可分為普通菌毛和性菌毛兩類(lèi)。
前者與細菌吸附和侵染宿主有關(guān),后者為中空管子,與傳遞遺傳物質(zhì)有關(guān)。 (五)繁殖 細菌一二分裂的方式繁殖,某些細菌處于不利的環(huán)境,或耗盡營(yíng)養時(shí),形成內生孢子,又稱(chēng)芽孢,是對不良環(huán)境有強抵抗力的休眠體,由于芽胞在細菌細胞內形成,故常稱(chēng)為內生孢子。
芽孢的生命力非常頑強,有些湖底沉積土中的芽抱桿茵經(jīng)500-1000年后仍有活力,肉毒梭菌的芽孢在ph 7.0時(shí)能耐受100℃煮沸5-9.5小。
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